技術(shù)文章
以下是經(jīng)過(guò)優(yōu)化的 siRNA轉(zhuǎn)染標(biāo)準(zhǔn)操作流程,整合了關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化與避坑指南,適用于絕大多數(shù)哺乳動(dòng)物細(xì)胞系(貼壁/懸浮),分為 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、操作步驟、質(zhì)控要點(diǎn)三部分:
一、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)關(guān)鍵點(diǎn)(轉(zhuǎn)染前必看)
要素 | 推薦方案 | 避坑提示 |
siRNA濃度 | 終濃度10-50nM(預(yù)實(shí)驗(yàn)梯度測(cè)試) | >100nM易致脫靶效應(yīng) |
細(xì)胞密度 | 貼壁細(xì)胞:30-50%匯合度 | 過(guò)密→毒性↑;過(guò)低→效率↓ |
轉(zhuǎn)染試劑 | Lipofectamine™ RNAiMAX(通用) | 避免含血清培養(yǎng)基稀釋試劑 |
對(duì)照設(shè)置 | - 陰性對(duì)照:Scrambled siRNA | 缺一不可! |
二、標(biāo)準(zhǔn)操作流程(以24孔板為例)
Day 0:細(xì)胞鋪板
1. 消化細(xì)胞 → 用wanquan培養(yǎng)基 調(diào)整密度 → 每孔接種 0.5mL(貼壁細(xì)胞數(shù):5-8×10?;懸浮細(xì)胞數(shù):2×10?)
2. 37℃培養(yǎng)箱放置 16-24h(目標(biāo):轉(zhuǎn)染時(shí)匯合度≈40%)
關(guān)鍵細(xì)節(jié):
- siRNA工作液濃度 = 儲(chǔ)存濃度×30(例:20μM儲(chǔ)存液→工作液終濃度≈33nM)
- 轉(zhuǎn)染試劑用量參考說(shuō)明書(shū)(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)
Day 2:換液與檢測(cè)
1. 轉(zhuǎn)染后 6h 更換wanquan培養(yǎng)基(高毒性細(xì)胞如原代神經(jīng)元需4h內(nèi)換液)
2. 繼續(xù)培養(yǎng) 24-72h(基因沉默峰值時(shí)間需預(yù)實(shí)驗(yàn)確定)
三、質(zhì)控關(guān)鍵步驟(決定成敗?。?/span>
1. 轉(zhuǎn)染效率驗(yàn)證(必做)
- 方案1:轉(zhuǎn)染 FAM標(biāo)記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)
- 方案2:共轉(zhuǎn)染 EGFP質(zhì)粒 → 計(jì)算綠色細(xì)胞占比(成本低但間接)
2. 沉默效果檢測(cè)
3. 細(xì)胞毒性評(píng)估
- MTT法:轉(zhuǎn)染后24h檢測(cè),存活率應(yīng)>85%
- 形態(tài)觀察:懸浮細(xì)胞聚團(tuán)、貼壁細(xì)胞空泡化→提示毒性過(guò)強(qiáng)
四、高頻問(wèn)題解決方案
問(wèn)題 | 原因 | 優(yōu)化方案 |
效率低 | siRNA降解/試劑失效 | 新解凍siRNA;更換轉(zhuǎn)染試劑批次 |
細(xì)胞死亡率高 | 復(fù)合物局部濃度過(guò)高 | 轉(zhuǎn)染前混勻培養(yǎng)基;懸浮細(xì)胞用旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)法 |
沉默效果不穩(wěn)定 | 基因半衰期長(zhǎng) | 延長(zhǎng)檢測(cè)至72h;轉(zhuǎn)染兩次(間隔24h) |
脫靶效應(yīng) | siRNA種子區(qū)匹配非靶基因 | 更換siRNA序列;使用化學(xué)修飾siRNA(如Stealth™) |
五、特殊細(xì)胞優(yōu)化方案
1. 原代細(xì)胞:
- 轉(zhuǎn)染試劑:選 DharmaFECT™ Primary 或 jetPRIME®
- 方案:轉(zhuǎn)染前饑餓處理2h(無(wú)血清培養(yǎng)基)→ 復(fù)合物孵育時(shí)間縮短至5min
2. 懸浮細(xì)胞:
- 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent
- 步驟:離心收集細(xì)胞 → 重懸于復(fù)合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)
3. 難轉(zhuǎn)細(xì)胞(如神經(jīng)元):
- 專用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)
- 轉(zhuǎn)染后不換液 → 直接補(bǔ)等體積wanquan培養(yǎng)基
六、試劑耗材推薦表
類型 | 推薦產(chǎn)品 | 適用場(chǎng)景 |
通用轉(zhuǎn)染試劑 | Lipofectamine™ RNAiMAX | 293T/HeLa等常見(jiàn)細(xì)胞 |
難轉(zhuǎn)細(xì)胞試劑 | jetPRIME® | 原代/干細(xì)胞/懸浮細(xì)胞 |
陽(yáng)性對(duì)照siRNA | Silencer™ GAPDH siRNA | 體系驗(yàn)證 |
陰性對(duì)照 | AllStars Neg. siRNA | 排除非特異效應(yīng) |
> 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn):合格實(shí)驗(yàn)需滿足——轉(zhuǎn)染效率>80% + 沉默效率>70% + 細(xì)胞存活>85%
避雷總結(jié):
1. 勿用含抗生素或血清的培養(yǎng)基稀釋復(fù)合物(滅活試劑)
2. 轉(zhuǎn)染后換液時(shí)間寧早勿晚(超8h毒性飆升)
3. 凍存siRNA避免反復(fù)凍融>3次(分裝儲(chǔ)存-80℃)
按照此流程操作,可穩(wěn)定獲得可重復(fù)的基因沉默數(shù)據(jù)!
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